图书馆始建于1928年，由书库、电子阅览室、借阅大厅等组成，目前总使用面积1,300余平方米。图书馆在植物专业图书和期刊等方面的馆藏量居全国之首。馆藏涵盖植物分类学、植物生态学、古植物学、植物生理学、植物地理学等学科。其中，尤以植物分类学文献收藏的历史悠久、种类丰富齐全而著称。图书馆与30多个国家和地区近50个单位长期保持着稳定的国际文献交换关系，并选购了多种国际公认的权威电子全文数据库，积极开展了全文传递、图书代借、论文收录引证、科技情报和查新等多项服务，满足了科研人员的文献需求和深层次知识服务需求。此外，图书馆还与国家标本资源共享平台（NSII）等国家重大科技基础条件平台项目建立紧密的合作共享关系，致力于生物多样性文献与数据的收藏、管理、整合和共享服务。