RNA编辑是基因转录后发生在前体RNA上的碱基替换。RNA编辑能够导致基因的编码产物发生改变,从而向中心法则提出过挑战。在动物的核基因组中,最常见的RNA编辑是从腺嘌呤到鸟嘌呤的改变。早期研究发现,阻止或者中断个别位点的RNA编辑会导致疾病的产生;这使得一些学者认为RNA编辑是“极其有益的”。近年来,随着基因组和转录组测序技术的发展,大量的RNA编辑位点被鉴定出来,RNA编辑的生物学意义也成为了大家热议的话题。
中科院植物研究所孔宏智研究组副研究员徐桂霞与美国密歇根大学张建之教授合作,对人类基因组中位于编码区的1783个RNA编辑位点进行了研究。研究发现,RNA编辑的水平和频率在功能重要的基因和位点中显著降低;与非编辑位点相比,编辑位点更容易发生腺嘌呤到鸟嘌呤的点突变;在受非同义RNA编辑影响的腺嘌呤中,进化上不保守的位点具有显著更高的编辑水平。结果表明,大多数RNA编辑并非有益,而是由RNA编辑酶对靶位点进行非特异性结合的副产物。研究为理解RNA编辑的起源和进化提供了新的线索。
相关成果于2月24日在线发表于PNAS(doi:10.1073/pnas.1321745111)期刊上,植物所为文章的第1单位,徐桂霞为第1作者。
该研究得到了国家自然科学基金和国家公派留学基金的资助。
(系统与进化植物学国家重点实验室供稿)
必需基因中非同义RNA编辑的频率和水平显著降低
Noness: nonessential genes; Ess: essential genes