2002年在中国科学院植物研究所获博士学位，2002年至2007年在美国华盛顿大学（圣.路易斯）进行博士后研究。2007年到中国科学院植物研究所工作，主要运用生物信息学手段整合不同类型数据挖掘耐逆分子模块，在Science Advances、Cell Reports、Annual Review of Plant Biology、Genome Biology、New Phytologist、Plant Journal等期刊发表多篇SCI论文， 主持中科院对外合作CAS-CSIRO项目、多项国家自然科学基金面上项目，中国科学院战略性先导科技专项“创建生态草牧业科技体系”牧草表型组平台负责人，作为子课题负责人参与国家重点研发计划、中国科学院战略性先导科技专项（A类/ B类）、转基因生物新品种培育重大专项等项目，2021年香山科学会议做大会主旨报告，Frontiers in Plant Science 审稿编辑。

主要研究方向

运用生物信息学手段整合不同类型数据解析水稻耐寒、苜蓿耐盐分子机制。

主持和参加的科研项目

[1] “基于AI和高光谱豆类作物耐盐表型实时评估技术及在牧草稳产中应用”，中科院对外合作CAS-CSIRO项目，2023-2026，项目主持人

[2] “基于多光学表型组和多组学联合分析的水稻耐低温基因精准挖掘”，国家自然科学基金面上项目，2023-2026，项目主持人

[3] “主要牧草盐碱等逆境适应优异基因模块挖掘与功能解析”，国家重点研发计划，2022-2027，子课题负责人

[4] “苜蓿耐盐性状解析与新材料分子选育”，中国科学院战略性先导科技专项（A类），2020-2025, 任务负责人

[5] “水稻低温感受及信号机制”，中国科学院战略性先导科技专项（B类），2018-2023, 子课题负责人

[6] “水稻抗逆性状形成的分子基础”，国家重点研发计划， 2016-2020, 子课题负责人

[7] “高频再生组培体系的建立和优化”，转基因生物新品种培育重大专项，2012-2016，2016-2020，子课题负责人

[8] “抗逆转基因水稻新品种培育”，转基因生物新品种培育科技重大专项, 2012-2016，2016-2020 子课题负责人

[9] “水稻亲环蛋白OsCYL与油菜素内酯信号传导组分的互作及其在植物体内的功能机制”，国家自然科学基金面上项目，2011-2013，项目主持人

[10] “利用单子叶植物二穗短柄草研究新miRNA耐低温分子机制”，国家自然科学基金面上项目，2010-2012，项目主持人

代表性论文

2023

Zhitao Li, Bo Wang, Wei Luo, Yunyuan Xu, Jinjuan Wang, Zhihui Xue, Yuda Niu, Zhukuan Cheng, Song Ge, Wei Zhang, Jingyu Zhang*, Qizhai Li*, Kang Chong*. Natural variation of codon repeats in COLD11 endows rice with chilling resilience. Science Advances. 2023. 9: eabq5506

2021

Wei Luo, Qing Huan, Yunyuan Xu, Wenfeng Qian, Kang Chong*, Jingyu Zhang*. Integrated global analysis reveals a vitamin E-vitamin K1 sub-network, downstream of COLD1, underlying rice chilling tolerance divergence. Cell Reports. 2021. 36:109397

2019

Jingyu Zhang, Xin-Min Li, Hong-Xuan Lin, Kang Chong. Crop improvement through temperature resilience. Annual Review of Plant Biology. 2019. 70:753-780

2018

Qing Huan, Zhiwei Mao, Kang Chong*, Jingyu Zhang*. Global analysis of H3K4me3/H3K27me3 in Brachypodium distachyon reveals VRN3 as critical epigenetic regulation point in vernalization and provides insights into epigenetic memory. New Phytologist. 2018. 219(4):1373-1387

2016

Jingyu Zhang*, Wei Luo, Yuan Zhao, Yunyuan Xu, Shuhui Song, and Kang Chong*. Comparative metabolomic analysis reveals a reactive oxygen species-dominated dynamic model underlying chilling environment adaptation and tolerance in rice. New Phytologist. 2016. 211: 1295-1310

2013

Jingyu Zhang, Zhiwei Mao, and Kang Chong*. A global profiling of uncapped mRNAs undercold stress reveals specific decay patterns and endonucleolytic cleavages in Brachypodium distachyon. Genome Biology. 2013. 14: R92

2010以前

Jingyu Zhang, Yunyuan Xu, Qing Huan, and Kang Chong*. Deep sequencing of Brachypodium small RNAs at the global genome level identifies microRNAs involved in cold stress response. BMC Genomics. 2009. 10: 449

Jingyu Zhang, Radomira Vankova, Jiri Malbeck, Petre Dobrev, Yunyuan Xu, Kang Chong, Michael Neff*. AtSOFL1 and AtSOFL2 act redundantly as positive modulators of the endogenous content of specific cytokinins in Arabidopsis. PLoS ONE. 2009. 4: e8236

Hao Chen, Jingyu Zhang, Michael Neff, Sukwhan Hong, Huiyong Zhang, Xingwang Deng, and Liming Xiong*. Integration of light and abscisic acid signaling during seed germination and early seedling development. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2008. 105: 4495-4500

Jingyu Zhang, Elizabeth Wrage, Radomira Vankova, Jiri Malbeck, and Michael Neff*. Overexpression of SOB5 suggests the involvement of a novel plant protein in cytokinin-mediated development. Plant Journal. 2006. 46: 834-848